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Sinopse
A disciplina oferece uma introdução abrangente à linguagem de programação R e ao ambiente RStudio, capacitando os alunos a realizar análises de dados de forma eficaz. Sem pré-requisitos, o curso inicia com os fundamentos da programação em R, como instalação, estrutura de dados e operações básicas. Através de projetos práticos e exercícios, os alunos consolidaram seus conhecimentos, simulando desafios reais de manipulação de dados. A parte central do curso se concentra na análise de dados, abrangendo desde a importação e limpeza de dados até a construção de modelos estatísticos. A visualização de dados será explorada com o uso de pacotes como ggplot2, permitindo a criação de gráficos informativos e personalizados. Apesar de ser uma disciplina introdutória, ao final, os alunos estarão aptos a desenvolver projetos completos de análise de dados, desde a coleta até a apresentação dos resultados. A avaliação será realizada através de atividades avaliativas semanais que irão compor a nota de cada unidade, proporcionando uma experiência de aprendizado prático.
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Conteúdos
Ementa
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Introdução a Bioinformática. Alinhamento de Sequências Biológicas. Princípios de Bancos de Dados. Buscas e integração de dados em Bancos de Dados Biológicos. Métodos de determinação de sequências biológicas. Análise de Genomas. Análise de Transcriptomas. Análise de Proteomas. Predição de Estrutura e Função de RNAs e Proteínas. Análise Filogenética e Evolucionárias de Sequências e Estruturas Biológicas.
Referências
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Livro: CLAVERIE, Jean-Michel; NOTREDAME, Cedric. <strong>Bioinformatics for dummies</strong>. 2nd ed. Hoboken, N.J.: Wiley Pub., c2007. xviii, 436 p. (--For dummies) ISBN: 9780470089859, 0470089857.
Livro: ZVELEBIL, Marketa; BAUM, Jeremy O. <strong>Understanding bioinformatics</strong>. New York: Garland science, c2008. 772 p. ISBN: 9780815340249.
Livro: GENTLEMAN, Robert. <strong>R programming for bioinformatics</strong>. Boca Raton, FL: CRC Press, c2009. 314 p. (Chapman & Hall/CRC computer science and data analysis series) ISBN: 9781420063677.
Livro: Hugo Verli. <strong>Bioinformática da Biologia à flexibilidade molecular</strong>. 1a. SBBq. 2014
Livro: Bioinformatics for dummies /
Livro: Hugo Verli. <strong>Bioinformática: da Biologia à Flexibilidade Moleculares</strong>. . e-book. 0000
Livro: Zvelebil, Marketa J,. <strong>Understanding bioinformatics</strong>. . Garland Science. 2018
Livro: Zvelebil, Marketa J. <strong>Understanding bioinformatics</strong>. . Garland Science.. 2018
Site: Bioinformática: da biologia à flexibilidade molecular
Livro: Princípios de bioquímica de Lehninger /
Livro: Understanding bioinformatics /
Outros: Bioinformática: da Biologia à Flexibilidade Moleculares
Outros: VERLI, H. (Org.) Bioinforma?tica da Biologia a? flexibilidade molecular - SBBq, 2014. 282 p.VERLI, H. (Org.) Bioinforma?tica da Biologia a? flexibilidade molecular - SBBq, 2014. 282 p.
Outros: TSAI, C. S. An introduction to computational biochemistry. John Wiley & Sons, 2002. 370 p.
Outros: Choudhuri S. Bioinformatics for Beginners: Genes, Genomes, Molecular Evolution, Databases and Analytical Tools. Elsevier, 2014.
Outros: SEETHARAM, A., Chudalayandi, S., Masonbrink, R., Muppirala, U., Rivers, A., Sayadi, M. e Severin, A. The Bioinformatics Workbook 2019. Zenodo. http://doi.org/10.5281/zenodo.3482894. Disponível em: https://bioinformaticsworkbook.org/.
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